～かゑで～様
コンテナの中身よりも断然ありえそうな原因が思い当たったのでご確認いただけますでしょうか。
完全に私の書き方が悪いのですが、AviUtl本体の方がmp4を読み込める状態になっていなければ、拡張編集プラグインの方だけ設定を行ってもmp4を読み込めません。
もしAviUtl本体でmp4を読み込むためのプラグインを導入されていないようでしたら、下記の記事を参照に「L-SMASH」というプラグインを導入してみてください。
<a href="/aviutl-mp4readin/" rel="nofollow">AviUtlでmp4やmovなどを読み込み可能にする方法</a>
記事の方は誤解を招きそうな点を訂正させていただきました。
もしL-SMASHをすでに導入済みであったり、導入してもうまくいかないようであればコンテナの中身も確認してみたほうが良いかもしれません。
ただ、コンテナの中身の確認は私も行ったことがないので、別サイトになりますが下記のサイトあたりを参考にされると良いかと思います。
<a href="http://matsu623a.blogspot.jp/2013/12/mp4.html" rel="nofollow">MP4コンテナの中身を調べる</a>
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